Obviamente antes de qualquer coisa faça um backup!
- Baixe nova versão do Moodle e descompacte no mesmo local do Moodle antigo.
- Para manter as configurações anteriores, substitua os arquivos config.php, temas e plugins.
config.php
theme/mytheme moodle/theme/mytheme
Acesse a página de administração, onde o Moodle detectará automaticamente a nova versão e irá executar todas as atualizações necessárias.
Pronto, o Moodle está atualizado!